مطالعه الگوهای توالی در پپتیدهای ضدمیکروبی با منشا گیاهی به کمک روش شبکه عصبی مصنوعی

پپتیدهای ضدمیکروب گروهی از فرآورده های طبیعی هستند و می توانند در حل معضل "مقاومت آنتی بیوتیکی" کمک کنند. بعضی از این پپتیدها منشاء گیاهی دارند. پپتیدهای ضدمیکروب فعالیت های ضد باکتری، ضد قارچ، ضد ویروس، ضد انگل و حتی ضد سرطانی دارند. پیدا کردن تفاوت ها بین این پپتیدها و سایر پپتیدهایی که فاقد خاصیت ضدمیکروبی هستند به ما کمک می کند که پپتیدهای ضد میکروب جدید را کشف و اثر گذاری آنها را بهینه کنیم. در این پژوهش دو مجموعه داده برای بررسی پپتیدهای ضدمیکروب گیاهی و پپتیدهای غیر آنتی میکروب تهیه شد و فراوانی آمینواسیدها و برخی صفات فیزیکوشیمیایی آنها با روش های آماری و شبکه عصبی بررسی شد. سه روش آماری استفاده شده در این پژوهش حداقل فاصله همینگ، حداقل فاصله اقلیدسی و حداقل فاصله ماهالانوبیس بود. بهترین نتیجه با روش شبکه عصبی مصنوعی نیز بررسی گردید.هرچند می توان با به کار گیری عوامل دیگر علاوه بر فراوانی آمینواسیدها، به دقت های تفکیک بالاتری نیز رسید.